哈爾濱工程大學源自1953年創辦的中國人民解放軍軍事工程學院（哈軍工），陳賡大將為首任院長，毛澤東主席為學院頒發《訓詞》，1959年被中共中央確定為全國重點大學。1966年退出軍隊序列更名為哈爾濱工程學院。1970年在哈軍工原址以海軍工程系為主體組建哈爾濱船舶工程學院（哈船院），1978年被國務院確定為全國重點大學。1994年更名為哈爾濱工程大學（哈工程）。學校先后隸屬于第六機械工業部、中國船舶工業總公司、國防科工委，現隸屬于工業和信息化部。2007年，成為國防科工委、教育部、黑龍江省人民政府、海軍共建高校。2019年，成為工業和信息化部、教育部、黑龍江省人民政府、哈爾濱市人民政府共建高校。
學校是首批具有博士、碩士學位授予權單位，1996年被確定為首批“211工程”重點建設高校，2002年經教育部批準設立研究生院，2011年被確定為國家優勢學科創新平臺項目建設高校，2017年進入國家“雙一流”建設行列。學校堅持“三海一核”（船舶工業、海軍裝備、海洋開發、核能應用）辦學方略，為我國船舶工業、核工業、國防現代化和經濟社會發展做出了重要貢獻，已成為我國船海核領域高水平研究型大學。
學校堅持勤儉辦學，全面貫徹新發展理念，建設節約型校園、人文校園、智慧校園、綠色校園、和諧校園、平安校園。2020年，學校入選全國文明校園。學校占地面積140.05萬平方米，建筑面積113.76萬平方米。校園建筑中西合璧，飛檐碧瓦，氣勢恢宏。學校設有23家教學科研單位，設有40多個科研機構以及150多個科研和教學實驗室，其中國家級重點實驗室3個，國家工程實驗室1個，國家地方聯合工程研究中心1個，中國-俄羅斯極地技術與裝備聯合實驗室1個，國家級國際科技合作基地3個，國家級學科創新引智基地6個，工業和信息化部重點實驗室18個，重點學科實驗室2個，教育部重點實驗室及工程研究中心8個，國家級電工電子教學基地1個，國家級實驗教學示范中心7個，國家級虛擬仿真實驗教學中心3個，國家大學生文化素質教育基地1個，國家級創新創業教育實踐基地1個，國家工程專業學位研究生聯合培養示范基地2個，教育部國別和區域研究中心1個，全國首批教育部-華為“智能基座”產教融合協同育人基地1個。學校哈軍工紀念館入選全國愛國主義教育示范基地，全國首批科學家精神教育基地、首批“大思政課”實踐教學基地。圖書館共有藏書759.8萬冊。
學校面向國家重大戰略需求，聚焦船海核領域，打造“高峰凸現、高原崛起”的“三海一核”特色學科體系，構建一流培優學科、一流培育學科、骨干支撐學科、基礎前沿學科、人文社會學科和新興交叉學科相互支撐、協同發展的學科生態。現有一級學科博士學位授權點15個，一級學科碩士學位授權點32個，博士專業學位類別3個，碩士專業學位類別11個，博士后科研流動站12個，博士后科研工作站3個。國家一級、二級重點學科各1個，省級一流學科13個。現有本科專業63個，國家級一流本科專業建設點33個，教育部特色專業7個，卓越工程師教育培養計劃專業7個，省級重點專業29個，4個專業入選國家級專業綜合改革試點項目。學校材料科學、工程學、化學、計算機科學進入ESI全球前1%。
學校堅持黨管人才原則，深入貫徹人才強國戰略，著力造就國際一流戰略科學家、領軍人才和創新團隊，培養具有國際競爭力的青年人才后備軍。學校現有教職工2945人，其中專任教師1916人，具有高級專業技術職務的專任教師1254人。教師隊伍中現有院士7人（含雙聘），“全國創新爭先獎”獲得者4人，各類國家級人才110人次，各類省部級人才120人次；“龍江學者”支持計劃入選者24人。教育部創新團隊2個，科技部創新人才推進計劃重點領域創新團隊2個，黑龍江省領軍人才梯隊8個。學校1人獲評“全國教書育人楷模”，1人獲評“全國先進工作者”，2支團隊入選“全國高校黃大年式教師團隊”。
學校堅守為黨育人、為國育才，全面落實立德樹人根本任務，堅持工學并舉，促進學生德智體美勞全面發展，突出視野寬、基礎厚、能力強、素質優、重創新的人才培養特色，致力于培養擔當民族復興大任的可靠頂用人才和引領未來發展的拔尖創新人才。學校現有學生3萬余人,其中本科生1.67萬余人、碩士研究生1.19萬余人、博士研究生3100余人。自2016年起，學校1人被中宣部、教育部評為“最美大學生”，4人榮獲“中國大學生年度人物提名獎”，5人榮獲“中國大學生年度人物入圍獎”。近年來，學生獲得國際級、國家級創新創業大賽重要獎項逾千項，“E唯”代表隊連續兩年獲國際水下機器人大賽冠軍，獲中國“互聯網+”大學生創新創業大賽先進集體獎，“挑戰杯”全國大學生課外學術科技作品競賽優勝杯，“挑戰杯”中國大學生創業計劃競賽優勝杯。學校被授予全國首批深化創新創業教育改革示范高校、全國創新創業典型經驗高校、全國高校實踐育人創新創業基地、國際級創新創業教育實踐基地、全國五四紅旗團委標兵、全國科普教育基地等稱號，“E唯”機器人創新團隊、“創翼”創新團隊獲全國大學生“小平科技創新團隊”，6名學生獲“中國青少年科技創新獎”。2011年成立創業教育學院。學校入選首批國家級創新創業教育實踐基地建設單位，全國首批深化創新創業教育改革示范高校、全國創新創業典型經驗高校、全國高校實踐育人創新創業基地、中國青年科技創新行動示范基地，獲評全國五四紅旗團委標兵、全國科普教育基地等稱號。本科生、研究生一次就業率保持在93%以上，連續多年位居全國高校前列，畢業生以“可靠頂用”而受到用人單位的廣泛贊譽，成為全國畢業生就業50所典型經驗高校之一。畢業生總體畢業去向落實率維持較高水平，連續15年位居黑龍江省榜首，畢業生去向主要為“三海一核”主體領域及國家戰略重要領域，近80%畢業生投身工業化、信息化和國防現代化建設，半數以上畢業生在世界及國內500強企業就業。全國百篇優秀博士學位論文及提名獲獎占全國船舶與海洋工程學科獲獎總數的40%。建校以來，學校為國家培養了近15萬名各類高級專門人才，其中包括200多名共和國的將軍、部長、省長、院士，近萬名高等院校、科研院所、大中型企業的技術領軍和高級管理人才，他們為國防現代化建設和國家經濟社會發展做出了重要貢獻。
學校堅持創新、引領、育人、報國的科研宗旨，面向世界科技前沿、面向經濟主戰場、面向國家重大需求、面向人民生命健康，大力弘揚和踐行科學家精神，精準對接國家戰略，強化有組織的科學研究和科研育人，產生重大原創性研究成果，突破關鍵核心技術，打造國家戰略科技力量，成為基礎研究的主力軍和重大科技突破的生力軍，擔當實現高水平科技自立自強的時代使命。科研工作一直是學校發展的先行力量，不僅以國內第一套條帶測深儀等數十項填補國內空白的重大科研成果著稱，而且還以雙工型潛器、氣墊船、梯度聲速儀等成果曾摘取世界第一的桂冠。學校在船海核領域保持著很強的技術儲備，水下機器人、船舶減搖、船舶動力、組合導航、水聲定位、水下探測、高性能船舶設計等技術居國內領先或國際先進地位，現已成為我國船舶科學技術基礎和應用研究的主力軍之一，是我國發展海洋高技術的重要依托力量。學校是我國首座數值水池虛擬實驗系統的聯合牽頭研制單位，是我國第七代超深水半潛式鉆井平臺、兩萬箱超大型集裝箱船、智能船舶核心設計研發單位。學校為我國首條三體搜救艇、萬噸集裝箱船、豪華游輪、鉆井平臺等新船型開發及深海工程裝備研發提供了全面的基礎技術支撐。在國內首次完成5艘AUV水聲組網。學校研制的“悟空號”深潛器成功自主下潛至10896m，是目前我國自主下潛最深的無人無纜深潛器。學校研制深水高精度水下綜合定位系統，保障蛟龍號、深海勇士號、奮斗者號多次深潛任務，獲國家技術發明二等獎并入選中國高校十大科技進展，“十三五”以來，承擔各類項目6200余項，獲得省部級以上科技獎勵160余項。科研產品質量管理通過ISO9000質量體系認證，是國內高校首家通過“雙認證”的大學。中國-俄羅斯極地技術與裝備聯合實驗室成為首批14家國家認定的實驗室。牽頭成立“深海工程與高技術船舶”“核安全與仿真技術”協同創新中心，獲工業和信息化部認定；“艦船動力”“先進海洋材料”協同創新中心獲黑龍江省認定。學校設有國家大學科技園，獲評“國家級科技企業孵化器”。學校人均科研經費位居全國高校前列。
學校堅持高水平對外開放合作，廣泛開展國際間學術研究、教育合作和人文交流，引進海內外優質教育資源，依法依規開展高水平中外合作辦學，提升學校的國際影響力和競爭力。學校與包括英國愛丁堡大學、澳大利亞悉尼大學、挪威科技大學、葡萄牙里斯本大學、俄羅斯圣彼得堡國立海洋技術大學以及國際原子能機構、世界五大船級社等世界一流大學、研究機構、國際組織和企業在內的25個國家100余個單位建立了良好穩定的合作關系。學校積極開展中外合作辦學，引進世界一流大學優質教育資源，與英國南安普頓大學聯合成立“哈爾濱工程大學南安普頓海洋工程聯合學院”，是教育部批準的中英首個船海特色合作辦學機構；與英國阿伯丁大學、英國斯旺西大學開展中外合作辦學項目。與烏克蘭國立南方師范大學聯合成立“孔子學院”，榮獲全球“先進孔子學院”稱號。學校是“中國政府獎學金”“國家建設高水平大學公派研究生”“創新型人才國際合作培養”項目實施高校，“中國政府原子能獎學金”項目、“中國政府海洋獎學金”項目、“居里夫人獎學金”項目委托培養單位，獲高教學會“全國來華留學工作先進集體”稱號。學校牽頭成立國際船舶與海洋工程創新與合作組織（簡稱ICNAME），是“北極大學聯盟”“中巴經濟走廊大學聯盟”“金磚國家大學聯盟”成員單位。學校每年選送500余名教師赴國（境）外進修、講學和科研合作，每年選派900多名學生到國際知名大學交流學習和訪問。每年接收1100余名國際學生來校學習。
學校堅持和發揚哈軍工優良傳統，將“以祖國需要為第一需要，以國防需求為第一使命，以人民滿意為第一標準”作為價值追求，秉承“大工至善，大學至真”的校訓，“忠誠、堅韌、團結、創新”的校風，“治學嚴謹、組織嚴密、要求嚴格”的教風，“嚴謹、求實、勤奮、創新”的學風，弘揚“以忠誠為靈魂、工學為境界、船海為特色、創新為動力”的大學文化。當前，學校完整、準確、全面貫徹新發展理念，以服務國家工業化、信息化、國防現代化及龍江振興發展為使命，以“雙一流”建設為統領，堅持內涵建設與內涵式發展道路，不斷提升辦學質量和水平，緊緊抓住“三海一核”領域及東北振興的國家戰略機遇，以敢為的自信、必成的勁頭、開放的眼界、合作的氣度，開啟全面創建特色鮮明世界一流大學新航程。
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